Νέα μέθοδος ανίχνευσης φυματίωσης με CRISPR
Ερευνητές του Πανεπιστημίου Tulane έχουν αναπτύξει μια προηγμένη δοκιμή φυματίωσης βασισμένη σε CRISPR, η οποία χρησιμοποιεί δείγμα από τη γλώσσα. Αυτή η καινοτόμος προσέγγιση θα μπορούσε να διευκολύνει τους ελέγχους σε κοινότητες, για την ανίχνευση της πιο θανατηφόρας μολυσματικής ασθένειας στον κόσμο.
Προβλήματα με τις παραδοσιακές μεθόδους
Οι τρέχουσες δοκιμές φυματίωσης βασίζονται σε δείγματα πτυέλων, δηλαδή βλέννας που συλλέγεται από τους πνεύμονες και το κατώτερο αναπνευστικό σύστημα. Αν και τα πτύελα περιέχουν μεγάλη ποσότητα βακτηρίων φυματίωσης, η συλλογή τους είναι δύσκολη και αναποτελεσματική για μαζικούς ελέγχους. Επιπλέον, η δοκιμή πτυέλων είναι αδύνατη σε περίπου 25% των συμπτωματικών περιπτώσεων και σχεδόν 90% των ασυμπτωματικών, γεγονός που συμβάλλει στην εκτίμηση ότι 4 εκατομμύρια περιπτώσεις φυματίωσης παραμένουν ανεπίγνωστες κάθε χρόνο.
Μια μελέτη που δημοσιεύθηκε στο Nature Communications, οι ερευνητές του Tulane εργάστηκαν για να γεφυρώσουν αυτό το κενό, βελτιώνοντας μια προηγουμένως αναπτυγμένη δοκιμή CRISPR για να ανιχνεύει καλύτερα τη φυματίωση σε δείγματα με πολύ χαμηλά επίπεδα βακτηρίων, όπως κοπριά, εγκεφαλονωτιαίο υγρό και δείγματα από τη γλώσσα.
Αποτελέσματα και προοπτικές
Κλινικές δοκιμές έδειξαν σημαντική αύξηση στην ανίχνευση της φυματίωσης σε δείγματα από τη γλώσσα σε σύγκριση με τις παραδοσιακές μεθόδους (74% έναντι 56%). Η νέα δοκιμή παρουσίασε επίσης υψηλή ευαισθησία στην ανίχνευση της φυματίωσης σε αναπνευστικά δείγματα (93%), σε κοπριά παιδιών (83%) και σε δείγματα εγκεφαλονωτιαίου υγρού ενηλίκων (93%). Με παιδιά, ασθενείς με HIV και άτομα με εξωπνευμονική φυματίωση που δεν μπορούν να παράγουν πτύελα, η έρευνα αποτελεί σημαντικό βήμα προς την κατεύθυνση της προσφοράς αποτελεσματικών διαγνώσεων μέσω μιας ποικιλίας δειγμάτων.
Πάνω από 10 εκατομμύρια άνθρωποι παγκοσμίως αρρωσταίνουν από φυματίωση κάθε χρόνο, αλλά το 40% αυτών των περιπτώσεων θεωρούνται χαμένες, καθώς οι άνθρωποι δεν διαγιγνώσκονται. Για να εντοπιστούν αυτές οι χαμένες περιπτώσεις, οι δοκιμές πρέπει να είναι λιγότερο επεμβατικές και πιο προσβάσιμες, προκειμένου να φτάσουν σε όσο το δυνατόν περισσότερους ανθρώπους που ενδέχεται να μην υποβληθούν σε έλεγχο.
Ο Tony Hu, PhD, επικεφαλής συγγραφέας και διευθυντής του Κέντρου Κυτταρικής και Μοριακής Διαγνωστικής του Tulane, δήλωσε ότι η ανάπτυξη μιας βιώσιμης δοκιμής φυματίωσης με δείγμα από τη γλώσσα θα μπορούσε να μεταμορφώσει τη διαδικασία ελέγχου σε κοινότητες με περιορισμένους πόρους. “Οι δείκτες από τη γλώσσα είναι ανώδυνοι, εύκολοι στη συλλογή και δεν απαιτούν εκπαιδευμένο ιατρικό προσωπικό,” είπε ο Huang. “Αυτό ανοίγει το δρόμο για μαζικούς ελέγχους.”
Η νέα μέθοδος CRISPR, γνωστή ως ActCRISPR-TB, αυξάνει την ενίσχυση και την ανίχνευση γενετικών σημάτων από το DNA των βακτηρίων φυματίωσης και προσφέρει μια γρήγορη, απλοποιημένη προσέγγιση που μπορεί να επιστρέψει μια διάγνωση σε λιγότερο από μία ώρα.
Για να εκτελούνται οι δοκιμές χωρίς την ανάγκη εργαστηρίου ή εκπαιδευμένου ιατρικού προσωπικού, οι ερευνητές ανέπτυξαν μια προσέγγιση “one pot”. Όπως και σε μια δοκιμή COVID-19, ένα δείγμα από τη γλώσσα προστίθεται σε έναν σωλήνα προφορτωμένο με μια ταινία δοκιμής και αντιδραστήριο. Ο σωλήνας αυτός επωάζεται και μετά από 45 λεπτά, οι χρωματιστές ταινίες στην ταινία θα υποδείξουν την παρουσία μόλυνσης.
Αν και απαιτείται περισσότερη έρευνα και ανάπτυξη, οι Hu και Huang δήλωσαν ότι αυτή η μελέτη αντιπροσωπεύει σημαντική πρόοδο. “Αν θέλουμε να τερματίσουμε τη φυματίωση, χρειαζόμαστε εργαλεία που λειτουργούν εκτός εργαστηρίου και στις κοινότητες όπου διαδίδεται η ασθένεια,” δήλωσε ο Hu.
