RNAConnect παρουσιάζει το UltramarathonRT Direct RNA-Seq Kit για να προωθήσει τη νανοπορική ανάλυση RNA
Η RNAConnect, μια εταιρεία που δραστηριοποιείται στον τομέα της βιοεπιστήμης, ανακοίνωσε σήμερα τη διάθεση του UltraMarathonRT® Direct RNA-Seq (uMRT DRS) Kit. Πρόκειται για μια καινοτόμο λύση προετοιμασίας βιβλιοθήκης RNA, σχεδιασμένη για την άμεση ανάλυση RNA μέσω της τεχνολογίας Oxford Nanopore Technologies®.
Βελτιωμένη ανάλυση RNA με νέο κιτ
Το νέο κιτ επιτρέπει την ανίχνευση περισσότερων γονιδίων, ισομορφών και μεγαλύτερων μεταγραφών σε σύγκριση με τις υπάρχουσες μεθόδους. Χρησιμοποιεί μια ήπια διαδικασία σταθεροποίησης αντίστροφης μεταγραφής στους 30 °C, σε συνδυασμό με την εξαιρετική απόδοση των ενζύμων, που διασφαλίζουν την ακεραιότητα του RNA και την εκπροσώπηση μεγάλων μεταγραφών.
Η διαδικασία Direct RNA-Seq απαιτεί αρχικά μια βήμα αντίστροφης μεταγραφής, που βοηθά στην ομαλοποίηση των δευτερευουσών δομών και στην σταθεροποίηση του RNA. Στη συνέχεια, το RNA διαβάζεται απευθείας μέσω της νανοπόρου, επιτρέποντας έτσι την ακριβή μέτρηση των ισομορφών και των τροποποιήσεων της βάσης.
Αξιοσημείωτα χαρακτηριστικά του UltraMarathonRT Direct RNA-Seq Kit
Σύμφωνα με τις πρώτες δοκιμές, το νέο κιτ προσφέρει σημαντικά πλεονεκτήματα σε σχέση με τις προτεινόμενες διαδικασίες. Συγκεκριμένα, η νέα χημεία και η χαμηλότερη θερμοκρασία αντίστροφης μεταγραφής (30 °C) οδηγούν σε:
- 25-50% υψηλότερη απόδοση cDNA
- 5-10% μεγαλύτερες αναγνωστικές μήκους, με σημαντικές διαφορές σε μεταγραφές άνω των 2 kb
- 1-2% περισσότερα ανιχνευμένα γονίδια
- 15-20% περισσότερες νέες μεταγραφές
- 25-30% περισσότερα γεγονότα διατήρησης εισόδων
- Ισοδύναμοι ρυθμοί χαρτογράφησης και βαθμοί Q
«Εξετάσαμε προσεκτικά τις υπάρχουσες διαδικασίες Direct RNA-seq και εντοπίσαμε περιοχές όπου η βαθιά γνώση μας για το RNA, σε συνδυασμό με τις μοναδικές ιδιότητες του UltraMarathonRT, μπορεί να ενισχύσει την παραγωγή μακρών αναγνωστικών RNA», δήλωσε ο Δρ. Jason Underwood, Αντιπρόεδρος Τεχνολογικής Ανάπτυξης της RNAConnect.
Η γνώμη των ειδικών
Ο Δρ. Paul Boutz, Βοηθός Καθηγητής στο Πανεπιστήμιο του Rochester, ο οποίος συμμετείχε ως δοκιμαστής του uMRT DRS Kit, τόνισε: «Οι τεχνολογίες μακράς ανάγνωσης έχουν την ικανότητα να προσπελάσουν πλήρως τις μεταγραφές, που μπορεί να είναι χιλιοστοί ή περισσότεροι σε μήκος. Δυστυχώς, οι περισσότερες αντίστροφες μεταγραφάσες δεν το επιτυγχάνουν. Αυτό μας εμπόδιζε να δούμε το πλήρες φάσμα της εναλλακτικής επεξεργασίας που συμβαίνει στις μεταγραφές, οπότε η ανακάλυψη του UltraMarathonRT ήταν καθοριστική. Το νέο uMRT DRS Kit ενσωματώνεται άψογα στη διαδικασία άμεσης ανάλυσης RNA και μας παρέχει εξαιρετικά αποτελέσματα. Σίγουρα θα το χρησιμοποιήσουμε για τις μελλοντικές μας αναλύσεις.
Η RNAConnect συνεχίζει να καινοτομεί στον τομέα της ανάλυσης RNA, προσφέροντας εργαλεία που διευκολύνουν τη δουλειά των ερευνητών και προάγουν τη γνώση μας για τη βιολογία του RNA.
